Nacida en la República de Macedonia del Norte (parte de la Antigua Yugoslavia), Marija Pendeva obtuvo su Título Superior de Piano en la Hochschule für Musik de Colonia y el Titulo Superior de Clave y Bajo Continuo (con Matricula de Honor) en el Real Conservatorio Superior de Música de Madrid.

Su actividad concertística y pedagógica se ha desarrollado principalmente en Madrid y Berlín. Como pianista y clavecinista acompañante ha trabajado para instituciones como el Teatro Real de Madrid, el Coro de Niños de la Comunidad de Madrid, el Conservatorio Profesional de Música Hindemith en Berlín, y la Hochschule für Musik en Colonia. 

En 2020 trabajó como pianista acompañante en dos producciones de ópera contemporánea para el Teatro Real de Madrid - Marie de Germán Alonso y Tránsito de Jesús Torres. Ha colaborado en numerosos proyectos con el Coro y Orquesta de Radio Televisión Española, el Coro y Orquesta de la Capilla Real de Madrid, Lautten Compagney y bajo la batuta de directores como J. Francés, A. Leaper, O. Gershensohn, G. Pehlivanian, W. Katschner y C. Soler. 

Ha colaborado en diversos ciclos, entre ellos, «Cantatas de Bach en recintos históricos» y en varios cursos de música vocal e instrumental, impartidos por maestros tales como G. Türk, P. Leenhouts, M. Buchholz y A. Lieberknecht.

En 2008, como ganadora del primer premio del Concurso de Música Antigua del RCSMM junto a Juan Rodríguez (flauta de pico) tocó medio recital en el Auditorio Nacional de Música interpretando obras de Castello y Veracini.

Como parte del Ensemble Komboï ha interpretado obras de música contemporánea en el festival drei D poesie 2018 y dentro del ciclo de conciertos Vang – músicas en vanguardia 2020, en el auditorio de CentroCentro Madrid. 

Actualmente forma parte, de manera estable, de un grupo de música de cámara junto a la soprano A. Grzywacz, la violinista A. Casals y el flautista J. Rodríguez, además de dedicarse a la enseñanza en el Centro Pedagógico Musical Arcos, donde imparte clases de piano, armonía y lenguaje musical.